Ich habe das gleiche Problem (Thumbs werden nicht richtig erstellt) und konnte es durch die vorgeschlagene Änderung auch beseitigen:
define('CONVERT_IS_GD2', 1);
leider funktioniert dann der User-Upload auf meiner Seite nicht mehr...
wenn ich die Änderung wieder rückgängig mache
define('CONVERT_IS_GD2', 0);
werden fast alle Thumbnails nicht richtig erstellt.
Ich weiss nicht ob mein Hoster GD upgedatet hat.
cu nizo